Bywają często oskarżani o rabunkową eksploatację raf. W rzeczywistości produktywność raf jest tak wielka, ryb akwariowych ma na nie wpływ nieznaczny w porównaniu spustoszeniem czynionym przez ludzi na innych terenach, raf koralowej może utrzymać 40 ton ryb rocznie, więcej niż eksport ze Sri Lanki, jednego z największych na świecie ryb akwariowych. Rządy niektórych państw, m.in. r, traktują rafy koralowe jak cenne bogactwo i zachęcają do ich odwiedzania oraz rozwijają międzynarodowy rybami. Stworzono wiele rezerwatów morskich, gdzie ie ryb jest wzbronione i gdzie prowadzi się badania, aby , jaki poziom eksploatacji raf byłby całkowicie bezpieczny, doża część ryb akwarystyka ginęła w czasie transportu, ale sytuacja się poprawiła, od kiedy Międzynarodowy Związek Rybami Ozdobnymi nałożył embargo na handel gatunkami za zagrożone lub niezdolne do życia w niewoli, w akwariach „żywych skałek" przez wiele lat kontrowersje. Obecnie w wielu handel nimi jest zabroniony. Większość tych skał, przez organizmy morskie, była pozyskiwana z raf, o poważne zniszczenia. Hodowcy znaleźli jednak pomiędzy rafą a brzegiem umieszcza się odpowiednie kawałki skał, a po kilku latach wyjmuje, zasiedlone już przez żywe organizmy. Głównymi źródłami „żywych skałek" są Karaiby, Zatoka Meksykańska, wybrzeża Kaliforni i Indonezji.
